MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009051	GCCG	2	8	1704404	1704411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_009051	AGGTGC	2	12	1704467	1704478	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4503	NC_009051	CGGGA	2	10	1704502	1704511	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4504	NC_009051	ACG	2	6	1704532	1704537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_009051	GGCA	2	8	1704550	1704557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_009051	TCCCT	2	10	1704601	1704610	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4507	NC_009051	T	6	6	1705267	1705272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009051	GGC	2	6	1705283	1705288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_009051	CCT	2	6	1705314	1705319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_009051	GCG	2	6	1705367	1705372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_009051	CCT	2	6	1705374	1705379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_009051	AGT	2	6	1705393	1705398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_009051	GGAA	2	8	1705433	1705440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_009051	GGAA	2	8	1705490	1705497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009051	GGCAC	2	10	1707053	1707062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4516	NC_009051	TTA	2	6	1707165	1707170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_009051	TA	3	6	1707189	1707194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_009051	CTG	2	6	1710271	1710276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_009051	CGC	2	6	1710286	1710291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_009051	ACAGA	2	10	1710385	1710394	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4521	NC_009051	GCC	2	6	1710411	1710416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_009051	CGG	2	6	1710495	1710500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_009051	CGTT	2	8	1710520	1710527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_009051	CGG	2	6	1710530	1710535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_009051	TGA	2	6	1710582	1710587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_009051	TGA	2	6	1710602	1710607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_009051	A	8	8	1710609	1710616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_009051	AGG	2	6	1712760	1712765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009051	A	6	6	1712776	1712781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_009051	CT	3	6	1714305	1714310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_009051	CCG	2	6	1714394	1714399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_009051	AGGG	2	8	1714405	1714412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_009051	TGG	2	6	1714422	1714427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009051	GC	3	6	1714430	1714435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_009051	T	6	6	1715320	1715325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_009051	CGTT	2	8	1715426	1715433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_009051	TGA	2	6	1715523	1715528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_009051	TCG	2	6	1715533	1715538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_009051	TAA	2	6	1715542	1715547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_009051	CCG	2	6	1716888	1716893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_009051	GAG	2	6	1716903	1716908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_009051	C	6	6	1716937	1716942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4543	NC_009051	GA	3	6	1719440	1719445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_009051	AGG	2	6	1719470	1719475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009051	ACC	2	6	1720198	1720203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_009051	CGGG	2	8	1720214	1720221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_009051	GGTCGA	2	12	1720228	1720239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4548	NC_009051	AAC	2	6	1720287	1720292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_009051	TCG	2	6	1724138	1724143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_009051	GAGCAC	2	12	1724323	1724334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_009051	G	6	6	1724361	1724366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_009051	CCCG	2	8	1724447	1724454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4553	NC_009051	CCT	3	9	1724463	1724471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_009051	CCCCG	2	10	1724516	1724525	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4555	NC_009051	GGGGGC	2	12	1724526	1724537	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
4556	NC_009051	GAGC	2	8	1724573	1724580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_009051	TCA	2	6	1724609	1724614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_009051	CCT	2	6	1724621	1724626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_009051	C	7	7	1724648	1724654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4560	NC_009051	CAGA	2	8	1724680	1724687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_009051	TC	3	6	1726959	1726964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_009051	CGG	2	6	1727438	1727443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_009051	TA	4	8	1727462	1727469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_009051	CGC	2	6	1727519	1727524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_009051	AT	3	6	1727992	1727997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_009051	ATC	2	6	1728066	1728071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_009051	GAG	2	6	1728081	1728086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009051	AT	3	6	1728639	1728644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_009051	ATT	2	6	1728649	1728654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_009051	GA	3	6	1728680	1728685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_009051	GAA	2	6	1728700	1728705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_009051	A	7	7	1728745	1728751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_009051	ATT	2	6	1731777	1731782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_009051	GTA	2	6	1731796	1731801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_009051	T	7	7	1735831	1735837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_009051	TTC	2	6	1735849	1735854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_009051	GGGA	2	8	1735977	1735984	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_009051	AGT	2	6	1736160	1736165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_009051	GTC	2	6	1736231	1736236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_009051	TAC	2	6	1736278	1736283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_009051	CCG	2	6	1737174	1737179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_009051	GCCG	2	8	1737185	1737192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_009051	T	6	6	1737211	1737216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_009051	GCT	2	6	1737261	1737266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_009051	CGA	2	6	1737302	1737307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_009051	AGC	2	6	1737327	1737332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_009051	GA	3	6	1737346	1737351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009051	AAT	2	6	1737365	1737370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009051	TGG	2	6	1737378	1737383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009051	ATG	2	6	1737630	1737635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_009051	T	6	6	1737661	1737666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_009051	GAG	2	6	1737667	1737672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_009051	GTA	2	6	1737743	1737748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009051	AT	3	6	1737950	1737955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_009051	CG	3	6	1737967	1737972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_009051	AT	3	6	1737981	1737986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_009051	ATT	2	6	1738008	1738013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_009051	TAA	2	6	1738018	1738023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_009051	TGG	2	6	1738482	1738487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009051	ATT	2	6	1738553	1738558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_009051	GAT	2	6	1738597	1738602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_009051	T	6	6	1738650	1738655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_009051	AAT	2	6	1738711	1738716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_009051	CAA	2	6	1738814	1738819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_009051	GAC	2	6	1738833	1738838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_009051	TA	3	6	1738862	1738867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_009051	AATT	2	8	1738868	1738875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_009051	TAT	2	6	1738877	1738882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_009051	TCT	2	6	1738915	1738920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_009051	CTC	2	6	1739734	1739739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_009051	T	6	6	1739855	1739860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_009051	TA	3	6	1739938	1739943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_009051	TAT	2	6	1739998	1740003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_009051	ATTT	2	8	1740182	1740189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_009051	TAAC	2	8	1740211	1740218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_009051	AAG	2	6	1740221	1740226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_009051	AAG	2	6	1740233	1740238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_009051	AATTA	2	10	1741238	1741247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_009051	TCC	2	6	1741412	1741417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_009051	CCT	2	6	1741422	1741427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_009051	GCC	2	6	1741499	1741504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_009051	CG	3	6	1741567	1741572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_009051	CGT	2	6	1741678	1741683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_009051	GCC	2	6	1741754	1741759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_009051	T	7	7	1742087	1742093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_009051	CAC	2	6	1742113	1742118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_009051	CTA	2	6	1742122	1742127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_009051	AGT	2	6	1742149	1742154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_009051	GGA	2	6	1742194	1742199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_009051	TGC	2	6	1743097	1743102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4632	NC_009051	GAT	2	6	1743798	1743803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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